Structures distinctes l'une de l'autre tant par la composition que par les attributions, les deux associations ont pour ambition commune la nécessaire cohérence des actions et politiques entreprises à l'échelle du Pays Basque.
C'est au terme de la première étape (1992-1994) de la démarche initiée avec Pays Basque 2010 que la collaboration entre les deux instances s'est concrétisée avec l’élaboration du projet de territoire (1995-1997).
Avec Pays basque 2020, de nouvelles modalités de travail en commun ont été mises en place pour resserer les liens entre ces deux instances complémentaires :
- Une commission mixte, structure commune au Conseil de développement et au Conseil des élus, est composée de 12 membres (émanant en particulier des bureaux des deux associations). Cette commission est chargée de porter une réflexion stratégique sur l’évolution du dispositif.
- Une assemblée plénière réunissant le Conseil de direction du Conseil de développement et le Conseil d’administration du Conseil des élus. Cette instance a été le lieu de validation des grandes étapes de Pays basque 2020. elle demeure un espace de réflexion autour des grands chantiers qui seront mis en œuvre dans les prochaines années.